Le dernier doom, soit disant un reboot, est au fait la suite de Doom 64, sorti sur N64 (évidemment).
Les circonstances ayant fait que Fly Taggart/Bj BlazcowiczIII/Doomguy soit retourné sur terre pour recevoir son armure praetor sont floues, mais on sait que pendant le temps qu il a passé en Enfer, il a combattu en tant que gladiateur, et à battu jusqu'au plus puissant guerrier de Satan.
Il est supposé avoir reçu son armure à ce moment là, et a traversé de multiples dimensions et univers, sans cesse combattant des démons.
Celui-ci retourna à nouveau en Enfer afin d'exterminer jusqu'à dernier démon, mais avant d'avoir pu éliminer le tout dernier, il s'est fait capturer, et ne pouvant être tué (il est le Doomslayer, plus ou moins protégé par Dieu) il fut emprisonné dans la pierre.
Pour Wolfenstein, c'est plus complexe, mais j'aime bien considérer que ça se passe sur différentes trames temporelles, BJ Blazcowicz a tué Hitler à la fin de Wolfenstein 3d, mais Return To Castle Wolfenstein semble se dérouler dans une dimension ou le furher est toujours vivant, on ne sait pas si il s'agit toujours d'Hitler, mais la suite montre la quête de Blazco de tuer le général Wilhelm Strasse (alias Deathshead) fournissant aux nazis des technologies monstrueuses et énormément plus évoluées que celles des alliés.
Tous les volets se suivent, et Wolfenstein The Old Blood à l'air de confirmer qu'Hitler est bel et bien mort (à travers les missions flashback).
Pour Quake c'est différent, Ranger combat l'entité Lovecraftienne connue sous le nom de Shub Niggurath ou Quake, du moins dans le premier volet, le deuxième ne se déroule pas dans le même monde, mais dans un futur ou une race extraterrestre, les Stroggs, sont bel et bien décidés à exterminer l'humanité, cette histoire est suivie dans Quake II et IV, on y prend successivement le contrôle de Bitterman, un soldat se retrouvant seul sur Stroggos, et de Matthew Kane, un marine de l'esquade Rhino qui a été victime d'atrocités commises par les Stroggs.
Quake III quant à lui, est comparable à Rayman M, il n'a pas de continuité avec l'univers Quake, on y voir même le Doomguy, renommé Doom pour le jeu.
Donc, ces jeux n'ont jamais vraiment été rebootés.
Et par ailleurs, Doom 3 est une préquelle à tous les Doom.
Pirez, get REKT !